Na stránkách praktika k této přednášce lze najít užitečné prezentace a další odkazy.

Na stránkách Praktika z molekulární taxonomie Vládi Hampla je možné najít spoustu užitečných návodů a rad od práce se sekvencemi přes nejrůznější testy až po fylogenetické analýzy.

1) stáhnout modeltest z internetu 2) do složky, kde mám soubor XXXX.nex, který chci analyzovat, zkopíruju modelblockPAUPb10.txt z adresáře Modeltestu 3) otevřu PAUP a načtu XXXX.nex 4) napsat příkaz: default lscores longftm=yes (náprava nějakého bugu z PAUPovský stránky; ale funguje to i bez...

V paupu otevřít nexus. Příkaz: export format=phylip file=XXX.phy; Vykopírovat blok sekvencí z nového phylipa a vložit do původního nexusu. A je to (non-interleaved je nastaven jako default).